Die Arp-Schnitger-Orgel präsentiert sich nach mehreren Restaurierungsversuchen im 20. Jahrhundert gegenwärtig in einem wenig befriedigenden Zustand. Zwar ist die Orgel bis auf geringe Einschränkungen spielbar, ihr Klangbild ist aber höchst inhomogen. Dies ist eine Folge von wiederholten Veränderungen an Winddruck und Intonation und der schlechten Qualität der rekonstruierten Register.
Daher hat der Kirchenvorstand der St. Pankratius-Gemeinde beschlossen, in den nächsten Jahren eine umfassende Restaurierung nach heutigen Maßstäben durchzuführen. Bei diesem Projekt handelt es sich um eine der letzten umfassenden Restaurierungen einer Schnitger-Orgel.
Ein Sachverständigen-Ausschuß, bestehend aus Dr. Joachim Walter, Martin Böcker und Hilger Kespohl wird in den nächsten Monaten den Rahmenplan für die Restaurierung erarbeiten.